« Garder le Circ à Lyon était un enjeu fort pour la Métropole de Lyon et la région Auvergne-Rhône-Alpes, territoire fortement impliqué dans la recherche contre le cancer, selon David Kimelfeld, président de la Métropole de Lyon. Comme Interpol, la dimension internationale de l'agence de l'Organisation mondiale de la santé est un atout. Les collectivités ont anticipé ce besoin nouveau en bâtiment pour conserver son siège social à Lyon. » D'autres villes, à l'étranger, avaient candidaté pour accueillir l'implantation du Circ. « La relocalisation » se fera au cœur du quartier biotech à Lyon Gerland.
La communauté scientifique de 300 personnes dont plus de 230 chercheurs issus de 50 nationalités s'installera d'ici 2021 rue du Vercors sur l'ex-site de l'Etablissement français du sang. Le Circ pourra accueillir jusqu'à 450 personnes. Le bâtiment de 11 300 m2 abritera des bureaux administratifs et de recherche (5 600 m2), des laboratoires (1 500 m2), des locaux communs avec notamment un auditorium (2 600 m2) et sa biobanque (1 500 m2). Son actuel tour de Lyon 8ème devrait être réhabilitée, et non détruite, par la Ville de Lyon qui n'a pas encore fait connaître sa destinée.
Le conseil de la Métropole du 15 décembre 2017 a approuvé la construction de ce siège et valide la subvention de 18 M€. A ses côtés, la Région accorde un financement de 13 M€ et l'Etat de 17 M€. Le Circ s'engage à hauteur de 1,2 M€. La Métropole de Lyon précise que « pour boucler les 51,6 M€ nécessaires au projet, le dépassement budgétaire sera négocié entre la Région et la Métropole ». La Ville de Lyon cède le foncier et couvre les frais liés à la dépollution et à la démolition du site.
A Lyon depuis 1967, le Circ est constitué par 28 états membres qui financent son budget annuel de 31 M€ destiné à la recherche, la prévention et l'identification des causes du cancer. Il organise des actions de prévention, éduque et forme les chercheurs, notamment des pays en voie de développement. Le Brésil, l'Inde et le Qatar ont récemment adhéré à l'agence.
